Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA1P25786 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA1P25786 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA1P25786 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA1P25786 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA1P25786 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA1P25786 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA1P25786 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA1P25786 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA1P25786 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA1P25786 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA1P25786 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA1P25786 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA1P25786 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA1P25786 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA1P25786 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA1P25786 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA1P25786 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA1P25786 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA1P25786 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA1P25786 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMA1P25786 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms