Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPGDP15428 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HPGDP15428 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HPGDP15428 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDP15428 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDP15428 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDP15428 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDP15428 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HPGDP15428 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HPGDP15428 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDP15428 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDP15428 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDP15428 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDP15428 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HPGDP15428 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HPGDP15428 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPGDP15428 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPGDP15428 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HPGDP15428 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPGDP15428 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPGDP15428 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDP15428 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDP15428 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDP15428 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPGDP15428 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPGDP15428 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPGDP15428 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPGDP15428 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPGDP15428 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPGDP15428 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDP15428 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDP15428 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDP15428 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPGDP15428 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDP15428 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDP15428 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDP15428 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDP15428 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPGDP15428 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPGDP15428 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDP15428 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDP15428 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDP15428 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDP15428 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPGDP15428 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDP15428 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDP15428 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDP15428 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDP15428 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPGDP15428 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPGDP15428 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms