Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TRIM27P14373 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
TRIM27P14373 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
TRIM27P14373 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms