Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HCLS1P14317 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
HCLS1P14317 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HCLS1P14317 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HCLS1P14317 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HCLS1P14317 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HCLS1P14317 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HCLS1P14317 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HCLS1P14317 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms