Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO3P0C6S8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO3P0C6S8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO3P0C6S8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms