Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GCNT3O95395 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GCNT3O95395 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCNT3O95395 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCNT3O95395 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCNT3O95395 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms