Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC24DO94855 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24DO94855 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEC24DO94855 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms