Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD5O60279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD5O60279 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD5O60279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms