Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA5O60264 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA5O60264 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMARCA5O60264 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA5O60264 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMARCA5O60264 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms