Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL13O43927 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL13O43927 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCL13O43927 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms