Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAFD1O14545 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAFD1O14545 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAFD1O14545 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAFD1O14545 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms