Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DFFAO00273 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DFFAO00273 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DFFAO00273 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DFFAO00273 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DFFAO00273 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DFFAO00273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DFFAO00273 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DFFAO00273 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DFFAO00273 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DFFAO00273 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DFFAO00273 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DFFAO00273 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DFFAO00273 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DFFAO00273 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DFFAO00273 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DFFAO00273 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DFFAO00273 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DFFAO00273 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DFFAO00273 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DFFAO00273 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DFFAO00273 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DFFAO00273 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DFFAO00273 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DFFAO00273 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DFFAO00273 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DFFAO00273 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DFFAO00273 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DFFAO00273 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DFFAO00273 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DFFAO00273 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DFFAO00273 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DFFAO00273 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DFFAO00273 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DFFAO00273 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DFFAO00273 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DFFAO00273 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DFFAO00273 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DFFAO00273 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DFFAO00273 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DFFAO00273 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DFFAO00273 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DFFAO00273 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DFFAO00273 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DFFAO00273 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DFFAO00273 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DFFAO00273 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DFFAO00273 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DFFAO00273 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DFFAO00273 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DFFAO00273 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DFFAO00273 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DFFAO00273 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DFFAO00273 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DFFAO00273 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DFFAO00273 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DFFAO00273 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DFFAO00273 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms