Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC2LH3BP13 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC2LH3BP13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms