Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NACAE9PAV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NACAE9PAV3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NACAE9PAV3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms