Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PGPEP1LA6NFU8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGPEP1LA6NFU8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1LA6NFU8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms