Protein–RNA interactions for Protein: A5D6W6

FITM1, Fat storage-inducing transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM1A5D6W6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FITM1A5D6W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FITM1A5D6W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FITM1A5D6W6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms