Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A0A0J9YXY3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 611.4 ms