Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV62

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV62 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV62 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV62 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV62 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV62 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV62 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV62 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV62 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV62 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV62 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV62 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV62 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV62 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV62 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WV62 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV62 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV62 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV62 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV62 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV62 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV62 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV62 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV62 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV62 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WV62 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WV62 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WV62 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV62 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV62 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WV62 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WV62 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A087WV62 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A087WV62 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A087WV62 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms