Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms