Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEC24CP53992 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms