RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432886.6

SRPX-202, Transcript of sushi repeat containing protein X-linked, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRPX, Length 1,725 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX-202ENST00000432886 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.56■■■■■ 4.24
SRPX-202ENST00000432886 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.59■■■■□ 3.45
SRPX-202ENST00000432886 ABCC9O60706 1549 aa35.11■■■■□ 3.21
SRPX-202ENST00000432886 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
SRPX-202ENST00000432886 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.47■■■■□ 3.11
SRPX-202ENST00000432886 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.35■■■■□ 3.09
SRPX-202ENST00000432886 NACADO15069 1562 aa34.17■■■■□ 3.06
SRPX-202ENST00000432886 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.15■■■■□ 3.06
SRPX-202ENST00000432886 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.05■■■■□ 3.04
SRPX-202ENST00000432886 SCRIBQ14160 1630 aa33.57■■■□□ 2.96
SRPX-202ENST00000432886 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.47■■■□□ 2.95
SRPX-202ENST00000432886 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.41■■■□□ 2.94
SRPX-202ENST00000432886 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.03■■■□□ 2.88
SRPX-202ENST00000432886 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.86
SRPX-202ENST00000432886 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.34■■■□□ 2.77
SRPX-202ENST00000432886 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
SRPX-202ENST00000432886 SMARCA4P51532 1647 aa32.12■■■□□ 2.73
SRPX-202ENST00000432886 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.1■■■□□ 2.73
SRPX-202ENST00000432886 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
SRPX-202ENST00000432886 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
SRPX-202ENST00000432886 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SRPX-202ENST00000432886 WIZO95785 1651 aa31.83■■■□□ 2.69
SRPX-202ENST00000432886 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.78■■■□□ 2.68
SRPX-202ENST00000432886 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.72■■■□□ 2.67
SRPX-202ENST00000432886 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.69■■■□□ 2.66
SRPX-202ENST00000432886 SMARCA2P51531 1590 aa31.68■■■□□ 2.66
SRPX-202ENST00000432886 NCAPD3P42695 1498 aa31.5■■■□□ 2.63
SRPX-202ENST00000432886 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
SRPX-202ENST00000432886 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
SRPX-202ENST00000432886 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.46■■■□□ 2.63
SRPX-202ENST00000432886 HMGXB3Q12766 1538 aa31.46■■■□□ 2.63
SRPX-202ENST00000432886 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.1■■■□□ 2.57
SRPX-202ENST00000432886 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
SRPX-202ENST00000432886 CFTRP13569 1480 aa30.65■■■□□ 2.5
SRPX-202ENST00000432886 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.64■■■□□ 2.5
SRPX-202ENST00000432886 NESP48681 1621 aa30.64■■■□□ 2.5
SRPX-202ENST00000432886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.59■■■□□ 2.49
SRPX-202ENST00000432886 PRDM2Q13029 1718 aa30.57■■■□□ 2.48
SRPX-202ENST00000432886 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.35■■■□□ 2.45
SRPX-202ENST00000432886 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.33■■■□□ 2.45
SRPX-202ENST00000432886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.32■■■□□ 2.44
SRPX-202ENST00000432886 ABCC8Q09428 1581 aa30.31■■■□□ 2.44
SRPX-202ENST00000432886 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.23■■■□□ 2.43
SRPX-202ENST00000432886 ERCC6Q03468 1493 aa30.16■■■□□ 2.42
SRPX-202ENST00000432886 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.15■■■□□ 2.42
SRPX-202ENST00000432886 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
SRPX-202ENST00000432886 SYNJ1O43426 1573 aa30.08■■■□□ 2.41
SRPX-202ENST00000432886 CUX1P39880 1505 aa30.06■■■□□ 2.4
SRPX-202ENST00000432886 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
SRPX-202ENST00000432886 MRC2Q9UBG0 1479 aa30■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 TOP2BQ02880 1626 aa29.99■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.99■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 TRIM41Q8WV44 630 aa29.99■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.98■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 TOPBP1Q92547 1522 aa29.95■■■□□ 2.39
SRPX-202ENST00000432886 WDR62O43379 1518 aa29.88■■■□□ 2.37
SRPX-202ENST00000432886 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.82■■■□□ 2.36
SRPX-202ENST00000432886 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SRPX-202ENST00000432886 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.66■■■□□ 2.34
SRPX-202ENST00000432886 CUX2O14529 1486 aa29.63■■■□□ 2.33
SRPX-202ENST00000432886 SOGA1O94964 1423 aa29.63■■■□□ 2.33
SRPX-202ENST00000432886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SRPX-202ENST00000432886 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
SRPX-202ENST00000432886 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.53■■■□□ 2.32
SRPX-202ENST00000432886 IFT140Q96RY7 1462 aa29.52■■■□□ 2.32
SRPX-202ENST00000432886 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.5■■■□□ 2.31
SRPX-202ENST00000432886 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
SRPX-202ENST00000432886 KIF27Q86VH2 1401 aa29.41■■■□□ 2.3
SRPX-202ENST00000432886 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SRPX-202ENST00000432886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SRPX-202ENST00000432886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.39■■■□□ 2.29
SRPX-202ENST00000432886 EEA1Q15075 1411 aa29.34■■■□□ 2.29
SRPX-202ENST00000432886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SRPX-202ENST00000432886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
SRPX-202ENST00000432886 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.31■■■□□ 2.28
SRPX-202ENST00000432886 PBRM1Q86U86 1689 aa29.27■■■□□ 2.28
SRPX-202ENST00000432886 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.22■■■□□ 2.27
SRPX-202ENST00000432886 IGF1RP08069 1367 aa29.19■■■□□ 2.26
SRPX-202ENST00000432886 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
SRPX-202ENST00000432886 GRIN2BQ13224 1484 aa29.17■■■□□ 2.26
SRPX-202ENST00000432886 CUL7Q14999 1698 aa29.11■■■□□ 2.25
SRPX-202ENST00000432886 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.08■■■□□ 2.25
SRPX-202ENST00000432886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.08■■■□□ 2.25
SRPX-202ENST00000432886 KIF21BO75037 1637 aa29.06■■■□□ 2.24
SRPX-202ENST00000432886 PRXQ9BXM0 1461 aa29.06■■■□□ 2.24
SRPX-202ENST00000432886 ADAMTS12P58397 1594 aa29.06■■■□□ 2.24
SRPX-202ENST00000432886 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.04■■■□□ 2.24
SRPX-202ENST00000432886 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
SRPX-202ENST00000432886 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29■■■□□ 2.23
SRPX-202ENST00000432886 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.98■■■□□ 2.23
SRPX-202ENST00000432886 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.97■■■□□ 2.23
SRPX-202ENST00000432886 GOLGA3Q08378 1498 aa28.94■■■□□ 2.22
SRPX-202ENST00000432886 SYNJ2O15056 1496 aa28.89■■■□□ 2.22
SRPX-202ENST00000432886 CHD1O14646 1710 aa28.85■■■□□ 2.21
SRPX-202ENST00000432886 GRIN2AQ12879 1464 aa28.83■■■□□ 2.21
SRPX-202ENST00000432886 FBLN2P98095 1184 aa28.83■■■□□ 2.21
SRPX-202ENST00000432886 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SRPX-202ENST00000432886 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SRPX-202ENST00000432886 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms