Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms