Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COQ4Q9Y3A0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COQ4Q9Y3A0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COQ4Q9Y3A0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COQ4Q9Y3A0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COQ4Q9Y3A0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms