Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DTX4Q9Y2E6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DTX4Q9Y2E6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DTX4Q9Y2E6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms