Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOD1Q9Y239 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NOD1Q9Y239 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NOD1Q9Y239 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NOD1Q9Y239 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms