Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLEC4AQ9UMR7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLEC4AQ9UMR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLEC4AQ9UMR7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.3 ms