Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECTD1Q9ULT8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECTD1Q9ULT8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HECTD1Q9ULT8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms