Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SS18L2Q9UHA2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SS18L2Q9UHA2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms