Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A6Q9P2U8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC17A6Q9P2U8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC17A6Q9P2U8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC17A6Q9P2U8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms