Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ITSN2Q9NZM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ITSN2Q9NZM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ITSN2Q9NZM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ITSN2Q9NZM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ITSN2Q9NZM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms