Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZDHHC3Q9NYG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZDHHC3Q9NYG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZDHHC3Q9NYG2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms