Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA2D2Q9NY47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA2D2Q9NY47 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA2D2Q9NY47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms