Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVK13-1Q9NX77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK13-1Q9NX77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVK13-1Q9NX77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms