Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCND1Q9NSA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCND1Q9NSA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCND1Q9NSA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCND1Q9NSA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms