Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
DUOX2Q9NRD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
DUOX2Q9NRD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
DUOX2Q9NRD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DUOX2Q9NRD8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms