Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS4Q9NQG7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPS4Q9NQG7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms