Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRCC1Q9NPI7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms