Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARS2Q9NP81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARS2Q9NP81 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARS2Q9NP81 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms