Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENND2DQ9H6A0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENND2DQ9H6A0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND2DQ9H6A0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms