Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIRPQ9GZT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLIRPQ9GZT3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLIRPQ9GZT3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIRPQ9GZT3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms