Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN4RQ9BZR6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4RQ9BZR6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTN4RQ9BZR6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms