Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP3Q9BWW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP3Q9BWW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP3Q9BWW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms