Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED9Q9BVK6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMED9Q9BVK6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMED9Q9BVK6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMED9Q9BVK6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms