Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRG3Q99928 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABRG3Q99928 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRG3Q99928 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRG3Q99928 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms