Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP4Q96PP9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP4Q96PP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP4Q96PP9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms