Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC43Q96MW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC43Q96MW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC43Q96MW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms