Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAM227BQ96M60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAM227BQ96M60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAM227BQ96M60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FAM227BQ96M60 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms