Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP47Q96K76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
USP47Q96K76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP47Q96K76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms