Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDLIM2Q96JY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDLIM2Q96JY6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDLIM2Q96JY6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms