Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF496Q96IT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNF496Q96IT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZNF496Q96IT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNF496Q96IT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNF496Q96IT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNF496Q96IT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNF496Q96IT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNF496Q96IT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNF496Q96IT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNF496Q96IT1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms